Ассоциации полиморфизмов некоторых генов с избыточным весом в популяционной выборке молодого населения Новосибирска

Цель исследования – изучить ассоциации полиморфизмов некоторых генов с избыточным весом и некоторыми антропометрическими и биохимическими показателями в популяционной выборке молодого населения Новосибирска. Материал и методы. Исследование проведено на выборке лиц 25–35 лет, проживающих в г. Новосибирске, отобранных методом случайных чисел (n = 319). В ходе обследования заполнялся опросник, проводились антропометрические измерения, забор крови с последующим биохимическим и молекулярно-генетическим исследованием. Результаты. Отношение шансов (ОШ) обнаружить носителя генотипа АА rs9939609 гена FTO в группе с повышенным индексом массы тела (ИМТ) по сравнению с группой с нормальным ИМТ в 2,1 раза выше (95%-й доверительный интервал (95 % ДИ) 1,2–3,8, р = 0,019 в модели АА vs AT + TT). В тесте Краскела – Уоллиса в общей группе обнаружены различия у носителей разных генотипов rs9939609 гена FTO по толщине кожной складки в средней трети правого плеча (р = 0,0008) и под правой лопаткой (р = 0,026). У носителей генотипа АА эти показатели оказались заметно выше по сравнению с носителями генотипов АТ и ТТ. У женщин обнаружены различия по содержанию холестерина липопротеинов высокой плотности (р = 0,032; наименьший уровень при генотипе АА) и холестерина липопротеинов низкой плотности (р = 0,027; наибольшее значение при генотипе АА). Кроме того, у носительниц генотипа ТТ rs7903146 гена TCF7L2 диастолическое артериальное давление оказалось меньше, чем у женщин с генотипами СТ и СС (р = 0,027). Вероятность обнаружить мужчину-носителя генотипов СТ или ТТ полиморфизма rs7903146 гена TCF7L2 в группе с ожирением составляет 0,313 (95 % ДИ 0,102–0,955; р = 0,036 в модели СС vs СT + TT) по сравнению с группой с избыточной массой тела (25 ≤ ИМТ < 30 кг/м2 ). ОШ обнаружить носительство аллеля С rs10811661 гена CDKN2AB в группе с ожирением в 2,2 раза выше (95 % ДИ 1,1–4,5; р = 0,035), чем у лиц с избыточной массой тела. Заключение. Ассоциация избыточного веса в популяционной выборке молодого населения Новосибирска подтверждена с rs9939609 гена FTO, rs7903146 гена TCF7L2, rs10811661 гена CDKN2AB. Не найдена ассоциация rs2237892 гена KCNQ1 и rs1111875 гена HHEX с избыточным весом. Обнаружены ассоциации изучаемых полиморфизмов с некоторыми антропометрическими и биохимическими показателями.

1. http://omim.org/

2. http://phgkb.cdc.gov/PHGKB/startPagePhenoPedia.action

3. Frayling T.M., Timpson N.J., Weedon M.N. et al. A common variant in the FTO gene is associated with body mass index and predisposes to childhood and adult obesity. Science, 2007; 316 (5826): 889–394. doi:10.1126/science.1141634

4. Nagrani R., Foraita R., Gianfagna F. et al. Common genetic variation in obesity, lipid transfer genes and risk of Metabolic Syndrome: Results from IDEFICS/I. Family study and meta-analysis. Sci Rep., 2020; 10 (1): 7189. doi:10.1038/s41598-020-64031-2

5. Ho A.J., Stein J.L., Hua X. et al. Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative. A commonly carried allele of the obesity-related FTO gene is associated with reduced brain volume in the healthy elderly. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 May 4; 107 (18): 8404–8409. doi:10.1073/pnas.0910878107. Epub 2010 Apr 19. PMID:20404173; PMCID: PMC2889537

6. Rivera M., Locke A.E., Corre T. et al. Interaction between the FTO gene, body mass index and depression: meta-analysis of 13701 individuals. Br. J. Psychiatry, 2017; 211 (2): 70–76. doi:10.1192/bjp.bp.116.183475. Epub 2017 Jun 22. Erratum in: Br. J. Psychiatry, 2017 Dec; 211 (6): 401. PMID:28642257; PMCID: PMC5537566

7. Jin T., Liu L. The Wnt signaling pathway effector TCF7L2 and type 2 diabetes mellitus. Mol. Endocrinol., 2008; 22 (11): 2383–2392.

8. Palmer N.D., Hester J.M., An S.S. et al. Resequencing and analysis of variation in the TCF7L2 gene in African Americans suggests that SNP rs7903146 is the causal diabetes susceptibility variant. Diabetes, 2011; 60 (2): 662–668.

9. Cruz M., Valladares-Salgado A., Garcia-Mena J. et al. Candidate gene association study conditioning on individual ancestry in patients with type 2 diabetes and metabolic syndrome from Mexico City. Diabetes Metab Res. Rev., 2010; 26 (4): 261–270.

10. Wang J., Kuusisto J., Vänttinen M. et al.Variants of transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) gene predict conversion to type 2 diabetes in the Finnish Diabetes Prevention Study and are associated with impaired glucose regulation and impaired insulin secretion. Diabetologia, 2007; 50 (6): 1192–1200.

11. Delgado-Lista J., Perez-Martinez P., García-Rios A. et al. Pleiotropic effects of TCF7L2 gene variants and its modulation in the metabolic syndrome: from the LIPGENE study. Atherosclerosis, 2011; 214 (1): 110–116.

12. Han X., Luo Y., Ren Q. et al. Implication of genetic variants near SLC30A8, HHEX, CDKAL1, CDKN2A/B, IGF2BP2, FTO, TCF2, KCNQ1, and WFS1 in type 2 diabetes in a Chinese population. BMC Med. Genet., 2010; 28 (11): 81.

13. Melzer D., Murray A., Hurst A.J. et al. Effects of the diabetes linked TCF7L2 polymorphism in a representative older population. BMC Med., 2006; 20 (4): 34.

14. Орлов П.С., Куликов И.В., Устинов С.Н. и др. Ассоциативный анализ некоторых однонуклеотидных полиморфных маркеров сахарного диабета второго типа с инфарктом миокарда // Бюл. СО РАМН, 2011; 5: 19–24.

15. Lukacs K., Hosszufalusi N., Dinya E. et al. The type 2 diabetes-associated variant in TCF7L2 is associated with latent autoimmune diabetes in adult Europeans and the gene effect is modified by obesity: a meta-analysis and an individual study. Diabetologia, 2012; 55 (3): 689–693. doi:10.1007/s00125-011-2378-z. Epub 2011 Nov 23. PMID:22109281

16. Kang E.S., Kim M.S., Kim C.H. et al. Association of common type 2 diabetes risk gene variants and posttransplantation diabetes mellitus in renal allograft recipients in Korea. Transplantation, 2009 Sep 15; 88 (5): 693–698.

17. Cheng X., Shi L., Nie S. et al. The same chromosome 9p21.3 locus is associated with type 2 diabetes and coronary artery disease in a Chinese Han population. Diabetes, 2011; 60 (2): 680–684.

18. Helgadottir A., Thorleifsson G., Magnusson K.P. et al. The same sequence variant on 9p21 associates with myocardial infarction, abdominal aortic aneurysm and intracranial aneurysm. Nat. Genet., 2008; 40 (2): 217–224. Epub 2008 Jan 6.

19. Gori F., Specchia C., Pietri S. et al. Common genetic variants on chromosome 9p21 are associated with myocardial infarction and type 2 diabetes in an Italian population. BMC Med. Genet., 2010; 19 (11): 60.

20. Liu J., Wang L., Qian Y. et al. Analysis of the interaction effect of 48 SNPs and obesity on type 2 diabetes in Chinese Hans. BMJ Open Diabetes Res. Care, 2020; 8 (2): e001638. doi:10.1136/bmjdrc-2020-001638. PMID:33203726; PMCID: PMC7674088

21. Орлов П.С., Иванощук Д.Е., Михайлова С.В. и др. Исследование ассоциаций новых генетических маркеров сахарного диабета второго типа на Çападно-Сибирской популяции европеоидов. Сибирский научный медицинский журнал, 2015; 35 (2): 74–79.

22. Li Y.Y., Wang X.M., Lu X.Z. KCNQ1 rs2237892 C→T gene polymorphism and type 2 diabetes mellitus in the Asian population: a meta-analysis of 15,736 patients. J. Cell Mol. Med., 2014; 18 (2): 274–282. doi:10.1111/jcmm.12185. Epub 2013 Dec 24. PMID:24373634; PMCID: PMC3930414

23. Li L., Yin J., Cheng H. et al. Identification of genetic and environmental factors predicting metabolically healthy obesity in children: data from the BCAMS study. J. Clin. Endocrinol. Metab., 2016: 101 (4): 1816–1825. doi:10.1210/jc.2015-3760. Epub 2016 Feb 25. PMID:26913634

24. Wen W., Zheng W., Okada Y. et al. Meta-analysis of genome-wide association studies in East Asianancestry populations identifies four new loci for body mass index. Hum. Mol. Genet., 2014; Oct 15; 23 (20): 5492–5504. doi:10.1093/hmg/ddu248. Epub 2014 May 26. PMID:24861553; PMCID: PMC4168820

25. Li C., Shen K., Yang M. et al. Association between single nucleotide polymorphisms in CDKAL1 and HHEX and type 2 Diabetes in Chinese Population. Diabetes Metab. Syndr. Obes., 2021; 13: 5113–5123. doi:10.2147/DMSO.S288587

26. Liju S., Chidambaram M., Mohan V., Radha V. Impact of type 2 diabetes variants identified through genomewide association studies in early-onset type 2 diabetes from South Indian population. Genomics Inform., 2020; 18 (3): e27. doi:10.5808/GI.2020.18.3.e27. Epub 2020 Sep 9. PMID:33017871; PMCID: PMC7560451

27. Staiger H., Stancáková A., Zilinskaite J., Vänttinen M., Hansen T., Marini M.A., Hammarstedt A., Jansson P.A., Sesti G., Smith U., Pedersen O., Laakso M., Stefan N., Fritsche A., Häring H.U. A candidate type 2 diabetes polymorphism near the HHEX locus affects acute glucose-stimulated insulin release in European populations: results from the EUGENE2 study. Diabetes, 2008; 57 (2): 514–517. doi:10.2337/db07-1254. Epub 2007 Nov 26. PMID:18039816