Журнал "Атеросклероз" создан в 2004 году по инициативе академика РАН Юрия Петровича Никитина, который и стал его главным редактором. Долгие годы журнал был единственным изданием в России по проблемам атеросклероза. С 2004 по 2019 год учредителем и издателем журнала был научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины Сибирского отделения РАН (НИИТПМ СО РАН). В 2017 году НИИТПМ СО РАН вошел в состав Федерального исследовательского центра ИЦиГ СО РАН, который с 2019 г. стал учредителем журнала.