Ассоциация однонуклеотидных полиморфизмов rs61999948, rs7172856 внезапной сердечной смертью
https://doi.org/10.15372/ATER20190402
Аннотация
Целью исследования является верификация ассоциации с внезапной сердечной смертью (ВСС) однонуклеотидных полиморфизмов rs7172856 и rs61999948, выявленных в качестве возможных новых молекулярно-генетических маркеров ВСС по результатам полногеномного аллелотипирования с использованием пулированной ДНК.
Материал и методы. Дизайн исследования – «случай – контроль». Группа ВСС сформирована с использованием критериев ВСС Европейского общества кардиологов из банка ДНК внезапно умерших жителей Октябрьского района г. Новосибирска (n = 437, средний возраст 53,1±9,0 года, доля мужчин 73,5 %, женщин – 26,5 %). Контрольная группа (n = 405, средний возраст 53,2±9,2 года, мужчины – 70,0 %, женщины – 30,0 %) подобрана по полу и возрасту к группе ВСС из банка ДНК участников проектов MONICA и HAPIEE. ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции из ткани миокарда в группе ВСС и венозной крови в контрольной группе. Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов.
Результаты. Не обнаружено статистически значимых различий по частотам генотипов и аллелей rs7172856 между группами ВСС и контроля (p > 0,05), в том числе при разделении групп по полу и возрасту. Доля носителей генотипа ТТ rs61999948 мужского пола в группе ВСС (6,3 %) статистически значимо меньше, чем в группе контроля (12,6 %) (отношение шансов (ОШ) = 0,47, 95 %-й доверительный интервал (95 % ДИ) 0,26–0,85, p = 0,011). Полученная значимость сохраняется в группе лиц младше 50 лет (p = 0,007) и в группе мужчин младше 50 лет (p = 0,002). Для лиц младше 50 лет доля носителей генотипа СС rs61999948 статистически значимо больше в группе ВСС (59,0 %), чем в контрольной группе (42,5 %) (ОШ = 1,94, 95 % ДИ 1,21–3,12, p = 0,006). Выявленная ассоциация генотипа СС с ВСС сохраняется и в группе мужчин младше 50 лет (p = 0,001).
Заключение. По результатам проведенного исследования не подтверждена ассоциация однонуклеотидного полиморфизма rs7172856 с ВСС. Для мужчин младше 50 лет генотип ТТ однонуклеотидного полиморфизма rs61999948 ассоциирован с протективным эффектом в отношении ВСС, генотип СС rs61999948 – с повышенным риском ВСС.
Ключевые слова
Об авторах
А. А. ИвановаРоссия
Иванова Aнастасия Aндреевна – канд. мед. наук, с.н.с. лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
В. Н. Максимов
Россия
Максимов Владимир Николаевич – д-р мед. наук, проф., зав. лабораторией молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
С. С. Малютина
Россия
Малютина Софья Константиновна – д-р мед. наук, проф., зав. лабораторией этиопатогенеза и клиники внутренних заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
В. П. Новоселов
Россия
Новоселов Владимир Павлович – д-р мед. наук, проф., начальни
630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134
И. А. Родина
Россия
Родина Ирина Александровна – канд. мед. наук, врач-судебно-медицинский эксперт
630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134
О. В. Хамович
Россия
Хамович Олеся Викторовна – канд. мед. наук, врач-судебно-медицинский эксперт
630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134
М. И. Воевода
Россия
Воевода Михаил Иванович – д-р мед. наук, проф., академик РАН, г.н.с. лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
Список литературы
1. Шляхто Е.В., Арутюнов Г.П., Беленков Ю.Н. Национальные рекомендации по определению риска и профилактике внезапной сердечной смерти // Арх. внутр. медицины. 2013. Т. 4, № 12. С. 5–15.
2. Lucena J.S. Sudden cardiac death // Forensic Sci. Res. 2019. Vol. 4, N 3. P. 199–201. doi: 10.1080/20961790.2019.1622062
3. Wong C.X., Brown A., Lau D.H. et al. Epidemiology of sudden cardiac death: Global and regional perspectives // Heart Lung Circ. 2019. Vol. 28, N 1. P. 6–14. doi: 10.1016/j.hlc.2018.08.026
4. Isbister J., Semsarian C. Sudden cardiac death: an update // Intern. Med. J. 2019. Vol. 49, N 7. P. 826– 833. doi: 10.1111/imj.14359
5. Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Кулакова Е.В., Сафронова Н.С., Воевода М.И., Рогаев Е.И. Полногеномный анализ пулированных выборок ДНК когорт человека // Вавил. журн. генетики и селекции. 2014. Т. 18, № 4-2. С. 847–855.
6. Priori S.G., Aliot E., Blшmstrom-Lundqvist C. et al. The task force for the management of patients with ventricular arrhythmias and the prevention of sudden cardiac death of the European Society of Cardiology (ESC) // G. Ital. Cardiol. 2016. Vol. 17, N 2. P. 108–170.
7. rs7172856. dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs7172856 (21 September 2019)
8. rs61999948. dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs61999948 (21 September 2019)
9. Максимов В.Н., Иванова А.А., Орлов П.С., Шахтшнейдер Е.В., Иванощук Д.Е., Савченко С.В., Воевода М.И. Исследование ассоциации полиморфизмов генов липидного обмена APOE, HL, SREBP2, USF1 с внезапной сердечной смертью в русской популяции // Атеросклероз. 2014. Т. 10, №1. С. 16–21
Рецензия
Для цитирования:
Иванова А.А., Максимов В.Н., Малютина С.С., Новоселов В.П., Родина И.А., Хамович О.В., Воевода М.И. Ассоциация однонуклеотидных полиморфизмов rs61999948, rs7172856 внезапной сердечной смертью. Атеросклероз. 2019;15(4):33-38. https://doi.org/10.15372/ATER20190402
For citation:
Ivanova A.A., Maksimov V.N., Malyutina S.K., Novoselov V.P., Rodina I.A., Hamovich O.V., Voevoda M.I. Association of single nucleotide polymorphisms rs61999948, rs7172856 with sudden cardiac death. Ateroscleroz. 2019;15(4):33-38. (In Russ.) https://doi.org/10.15372/ATER20190402