Проверка 8 ОНП на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда у жителей Новосибирска

   Цель исследования: проверка однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), идентифицированных в недавних полногеномных ассоциативных исследованиях на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда (ИМ) в сибирской популяции.

   Материал и методы. Группа больных ИМ и контрольная группа были сформированы на основе популяционной выборки 45–69-летних жителей г. Новосибирска (9400 человек), которая была собрана в ходе работы по международному проекту HAPIEE (Health, Alcohol and Psychosocial factors in Eastern Europe). Всего отобрано 94 больных (60 мужчин и 34 женщины, перенесших инфаркт миокарда после начала исследования HAPIEE). Контрольная группа: лица без ИМ (420 человек), подобранная по полу и возрасту. Геномную ДНК выделяли из венозной крови методом фенол-хлороформной экстракции. Полиморфизм генов тестировали с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени в соответствии с протоколом фирмы-производителя (зонды TaqMan, Applied Biosystems, USA) на приборе ABI 7900HT. В исследование взяты следующие ОНП: rs499818, rs619203, rs10757278 и rs1333049, rs1376251, rs2549513, rs4804611, rs17465637. Результаты. Для rs10757278 и rs1333049 показана ассоциация с ИМ ОШ = 1,78 (95 % ДИ 1,07–2,97 р = 0,03 GG vs СС+CG) и СС ОШ = 1,78–1,78 (95 % ДИ 1,07–3,02, р = 0,03 СС vs GС+GG) соответственно. Для rs1376251 (TAS2R50) показана протективная роль в отношении ИМ, генотип ТТ ОШ = 0,22 (95 % ДИ 0,05–0,91, р = 0,02 TT vs CC+CT), для остальных ОНП статистически достоверных данных получено не было.

   Выводы: подтверждены ассоциации rs1333049 (хр. 9), rs10757278 (хр. 9) с инфарктом миокарда и показана новая для России ассоциация с риском развития инфаркта миокарда rs1376251 (TAS2R50).

1. Horne B. D., Carlquist J. F., Muhlestein J. B. et al. Associations with myocardial infarction of six polymorphisms selected from a three-stage genome-wide association study // Am. Heart J. 2007. Nov; Vol. 154, N 5. P. 969–975.

2. Larson M. G., Atwood L. D., Benjamin E. J. et al. Framingham Heart Study 100K project: genome-wide associations for cardiovascular disease outcomes // BMC Med. Genet. 2007. Vol. 19, N 8. Suppl 1. P. S5.

3. Ozaki K., Tanaka T. Genome-wide association study to identify single-nucleotide polymorphisms conferring risk of myocardial infarction // Methods Mol. Med. 2006. Vol. 128. P. 173–180.

4. Samani N. J., Erdmann J., Hall A. S. et al. Genomewide association analysis of coronary artery disease // N. Engl. J. Med. 2007. Vol. 2357. P. 443–453.

5. Hiura Y., Fukushima Y., Yuno M. et al. Validation of the association of genetic variants on chromosome 9p21 and 1q41 with myocardial infarction in a Japanese population // Circ. J. 2008. Vol. 72, N 8. P. 1213–1217.

6. Schunkert H., Götz A., Braund P. et al. Repeated replication and a prospective meta-analysis of the association between chromosome 9p21.3 and coronary artery disease // Circulation. 2008. Vol. 117, N 13. P. 1675–1684.

7. Shen G. Q., Li L., Rao S. et al. Four SNPs on chromosome 9p21 in a South Korean population implicate a genetic locus that confers high cross-race risk for development of coronary artery disease // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2008. Vol. 28, N 2. P. 360–365.

8. Van der Net J. B., Oosterveer D. M., Versmissen J. et al. Replication study of 10 genetic polymorphisms associated with coronary heart disease in a specific high-risk population with familial hypercholesterolemia // Eur. Heart J. 2008. Vol. 29, N 18. P. 2195–2201.

9. MONICA Monograph and Multimedia Sourcebook. World,s largest study of heart disease, stroke, risk factors, and population trends 1979–2002. Edited by Hugh Tunstall-Pedoe (with 64 other contributors for the WHO MONICA Project). WHO, Geneva, 2003. 237 р.

10. Смит К. Пульс-электрофорез и методы работы с большими молекулами ДНК / К. Смит, С. Калко, Ч. Кантор; под ред. К. Дейвиса // Анализ генома: пер. с англ. – М.: Мир, 1990. – С. 58–94.

11. Максимов В. Н. Проверка взаимосвязи между девятью однонуклеотидными полиморфизмами и инфарктом миокарда на сибирской популяции / В. Н. Максимов [и др.] // Вестн. РАМН. – 2012. – № 5. – С. 24–29.

12. Helgadottir A., Thorleifsson G., Magnusson K. P. et al. The same sequence variant on 9p21 associates with myocardial infarction, abdominal aortic aneurysm and intracranial aneurysm // Nat. Genet. 2008. Vol. 40 (2). P. 217–224.

13. Anderson C. D., Biffi A., Rost N. S. et al. Chromosome 9p21 in Ischemic Stroke. Population Structure and Meta-Analysis // Stroke. 2010. Vol. 41, N 6. P. 1123–1131.

14. Шестерня П. А. Генетические предикторы инфаркта миокарда у лиц молодого возраста / П. А. Шестерня [и др.] // Кардиология. – 2013. – № 7. – С. 4–8.

15. Куликов И. В. Генетические маркеры тяжести поражения коронарных сосудов у больных с острым коронарным синдромом / И. В. Куликов [и др.] // Бюл. СО РАМН. – 2013. – № 4. – С. 65–70.

16. Ellis K. L., Pilbrow A. P., Frampton C. M. et al. A Common Variant at Chromosome 9P21.3 Is Associated with Age of Onset of Coronary Disease but Not Subsequent Mortality // Circ. Cardiovasc. Genet. 2010. Vol. 3, N 3. P. 286–293.

17. Buysschaert I., Carruthers K. F., Dunbar D. R. et al. A variant at chromosome 9p21 is associated with recurrent myocardial infarction and cardiac death after acute coronary syndrome: The GRACE Genetics Study // Eur. Heart J. 2010. Vol. 31, N 9. P. 1132–1141.

18. Theodoraki E. V., Nikopensius T., Suhorutsenko J. et al. ROS1 Asp2213Asn polymorphism is not associated with coronary artery disease in a Greek case-control study // Clin. Chem. Lab. Med. 2009. Vol. 47, N 12. P. 1471–1473.

19. Shiffman D., Ellis S. G., Rowland C. M. et al. Identification of four gene variants associated with myocardial infarction // Am. J. Hum. Genet. 2005. Vol. 77. P. 596–605.

20. Yamada Y., Kato K., Oguri M. et al. Genetic risk for myocardial infarction determined by polymorphisms of candidate genes in a Japanese population // J. Med. Genet. 2008. Vol. 45, N 4. P. 216–221.

21. Myocardial Infarction Genetics Consortium Genomewide association of early-onset myocardial infarction with single nucleotide polymorphisms and copy number variants // Nat. Genet. 2009. Vol. 41, N 3. P. 334–341.

22. Bressler J., Folsom A. R., Couper D. J. et al. Genetic variants identified in a European genomewide association study that were found to predict incident coronary heart disease in the atherosclerosis risk in communities study // Am. J. Epidemiol. 2010. Vol. 171, N 1. P. 14–23.