Aнастасия Aндреевна Иванова, канд. мед. наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярногенетических исследований терапевтических заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
Anastasiya A. Ivanova, candidate of medical sciences, senior researcher at the laboratory of molecular genetic studies of therapeutic diseases
175/1, Boris Bogatkov str., Novosibirsk, 630089
Динара Евгеньевна Иванощук, научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
Dinara E. Ivanoshchuk, researcher at the laboratory of molecular genetic studies of therapeutic diseases
175/1, Boris Bogatkov str., Novosibirsk, 630089
Павел Сергеевич Орлов, научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
Pavel S. Orlov, researcher at the laboratory of molecular genetic studies of therapeutic diseases
175/1, Boris Bogatkov str., Novosibirsk, 630089
Ирина Александровна Родина, кандидат медицинских наук, врач-судебно-медицинский эксперт
630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134
Irina A. Rodina, candidate of medical sciences, doctor of forensic medicine
134, Nemirovich-Danchenko str., Novosibirsk, 630087
Олеся Викторовна Хамович, канд. мед. наук, врач-судебно-медицинский эксперт
630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134
Olesya V. Khamovich, candidate of medical sciences, doctor of forensic medicine
134, Nemirovich-Danchenko str., Novosibirsk, 630087
Софья Константиновна Малютина, д-р мед. наук, проф., зав. лабораторией этиопатогенеза и клиники внутренних заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
Sofya K. Malyutina, doctor of medical sciences, professor, head of the laboratory of etiopathogenesis and clinic of internal medicine
175/1, Boris Bogatkov str., Novosibirsk, 630089
Владимир Павлович Новоселов, д-р мед. наук, проф., начальник
630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134
Vladimir P. Novoselov, doctor of medical sciences, professor, head
134, Nemirovich-Danchenko str., Novosibirsk, 630087
Владимир Николаевич Максимов, д-р мед. наук, проф., зав. лабораторией молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1
630091, г. Новосибирск, Красный просп., 52
Vladimir N. Maksimov, doctor of medical sciences, professor, head of the laboratory of molecular genetic studies of therapeutic diseases
175/1, Boris Bogatkov str., Novosibirsk, 630089
52, Krasnyj av., Novosibirsk, 630091
В одной трети случаев причина внезапной смерти остается необъясненной после проведения стандартного судебно-медицинского исследования. При отрицательной аутопсии во многих странах рекомендовано проведение посмертного молекулярно-генетического исследования.
Цель исследования – оценить диагностическую значимость молекулярной аутопсии методом экзомного секвенирования для мужчин молодого возраста, умерших внезапной сердечной смертью (ВСС).
Материал и методы. Выполнено экзомное секвенирование ДНК группы молодых мужчин (37 человек), умерших ВСС в возрасте до 45 лет (средний возраст 32,4 ± 6,4 года). ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции из ткани миокарда. Экзомный анализ выполнен на платформе Illumina. Для некоторых из выявленных вариантов проведено подтверждающее прямое автоматическое секвенирование по Сэнгеру.
Результаты. Из 37 образцов ДНК при анализе результатов секвенирования 205 генов обнаружено более 30 вариантов в 17 образцах (46 %), вероятно имеющих отношение к фенотипу ВСС. Найденные мутации локализованы в генах, ассоциированных с фенотипами, приводящими к развитию ВСС (дилатационная или гипертрофическая кардиомиопатия, нарушения ритма сердца).
Заключение. Впервые в России проведено экзомное секвенирование образцов ДНК мужчин, умерших ВСС в возрасте до 45 лет. Молекулярная аутопсия методом экзомного секвенирования – эффективный метод поиска причинных вариантов нуклеотидной последовательности при ВСС.
In one third of cases, the cause of sudden death remains unexplained after a standard forensic examination. If autopsy is negative, post-mortem molecular genetic testing is recommended in many countries.
The aim of the study was to evaluate the diagnostic significance of molecular autopsy by exome sequencing for young men who died of sudden cardiac death (SCD).
Material and methods. Exome sequencing of a group of young men (n = 37) who died SCD at the age under 45 years (mean age 32.4 ± 6.4 years) was performed. DNA was isolated by phenol-chloroform extraction from myocardial tissue. Whole exome analysis was performed on the Illumina platform. Confirmatory direct automated Sanger sequencing was performed for some of the identified variants.
Results. Of the 37 samples with SCD, analysis of 209 gene sequencing results revealed more than 30 variants in 17 samples (46 %) likely related to the SCD phenotype. The mutations found are localized in the genes associated with phenotypes leading to the development of SCD (HCM, DCM, cardiac arrhythmias).
Conclusions. For the first time in Russia, exome sequencing of DNA samples for men who died from SCD before the age of 45 was performed. Molecular autopsy by exome sequencing is an effective method for searching for causal variants of the nucleotide sequence in SCD.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.