aterosklerozАтеросклерозAteroscleroz2078-256X2949-3633НИИТПМ-филиал ИЦиГ СО РАНateroskleroz-736Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESПроверка 8 ОНП на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда у жителей НовосибирскаReplication of association 8 SNPs with myocardial infarction in the siberian populationsОрловП. С.OrlovP. S.

Павел Сергеевич Орлов, аспирант

630089

Бориса Богаткова, 175/1

Новосибирск

630089

Boris Bogatkov str., 175/1

SB RAS

Institute of Cytology and Genetics

630090

Akademik Lavrent`ev av., 10

Novosibirsk

orlovpavel86@gmail.comМаксимовВ. Н.MaksimovV. N.

Владимир Николаевич Максимов, д-р мед. наук, зав. лабораторией

630089

лаборатория молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний

Бориса Богаткова, 175/1

СО РАН

Институт цитологии и генетики

630090

просп. Академика Лаврентьева, 10

ГБОУ ВПО «Новосибирский государственный медицинский университет»

630091

Красный просп., 52

Новосибирск

630089

Boris Bogatkov str., 175/1

Novosibirsk State Medical University

630091

Krasny av., 52

Novosibirsk

medik11@mail.ruГафаровВ. В.GafarovV. V.

Валерий Васильевич Гафаров, д-р мед. наук, проф., зав. лабораторией

лаборатория психологических и социологических проблем терапевтических заболеваний

630089

Бориса Богаткова, 175/1

Новосибирск

630089

Boris Bogatkov str., 175/1

Novosibirsk

valery.gafarov@gmail.comМалютинаС К.MalyutinaS. K.

Софья Константиновна Малютина, д-р мед. наук, проф., рук. группы неинвазивной диагностики

630089

Бориса Богаткова, 175/1

Новосибирск

630089

Boris Bogatkov str., 175/1

Novosibirsk

smalyutina@hotmail.comРомащенкоА. Г.RomashchenkoA. G.

Аида Герасимовна Ромащенко, канд. биол. наук, ведущий научный сотрудник

СО РАН

Институт цитологии и генетики

630090

просп. Академика Лаврентьева, 10

Новосибирск

SB RAS

Institute of Cytology and Genetics

630090

Akademik Lavrent`ev av., 10

Novosibirsk

romasch@bionet.nsc.ruВоеводаМ. И.VoevodaM. I.

Михаил Иванович Воевода, д-р мед. наук, проф., член-корр., директор

630089

Бориса Богаткова, 175/1

СО РАН

Институт цитологии и генетики

просп. Академика Лаврентьева, 10

630090

Новосибирск

630089

Boris Bogatkov str., 175/1

SB RAS

Institute of Cytology and Genetics

630090

Akademik Lavrent`ev av., 10

Novosibirsk

mvoevoda@ya.ruФГБНУ «НИИ терапии и профилактической медицины»РоссияInstitute of Internal and Proventive Medicine; RASRussian FederationФГБНУ «НИИ терапии и профилактической медицины»; РАН; Минздрав РоссииРоссияInstitute of Internal and Proventive Medicine; Minzdrav of RussiaRussian FederationФГБНУ «НИИ терапии и профилактической медицины»РоссияInstitute of Internal and Proventive MedicineRussian FederationРАНРоссияRASRussian FederationФГБНУ «НИИ терапии и профилактической медицины»; РАНРоссияInstitute of Internal and Proventive Medicine; RASRussian Federation2015160420221111419Copyright © Орлов П.С., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И., 20222022Орлов П.С., Максимов В.Н., Гафаров В.В., Малютина С.К., Ромащенко А.Г., Воевода М.И.Orlov P.S., Maksimov V.N., Gafarov V.V., Malyutina S.K., Romashchenko A.G., Voevoda M.I.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://ateroskleroz.elpub.ru/jour/article/view/736   Цель исследования

   Цель исследования: проверка однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП), идентифицированных в недавних полногеномных ассоциативных исследованиях на пригодность в качестве маркеров риска развития инфаркта миокарда (ИМ) в сибирской популяции.

   Материал и методы

   Материал и методы. Группа больных ИМ и контрольная группа были сформированы на основе популяционной выборки 45–69-летних жителей г. Новосибирска (9400 человек), которая была собрана в ходе работы по международному проекту HAPIEE (Health, Alcohol and Psychosocial factors in Eastern Europe). Всего отобрано 94 больных (60 мужчин и 34 женщины, перенесших инфаркт миокарда после начала исследования HAPIEE). Контрольная группа: лица без ИМ (420 человек), подобранная по полу и возрасту. Геномную ДНК выделяли из венозной крови методом фенол-хлороформной экстракции. Полиморфизм генов тестировали с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени в соответствии с протоколом фирмы-производителя (зонды TaqMan, Applied Biosystems, USA) на приборе ABI 7900HT. В исследование взяты следующие ОНП: rs499818, rs619203, rs10757278 и rs1333049, rs1376251, rs2549513, rs4804611, rs17465637. Результаты. Для rs10757278 и rs1333049 показана ассоциация с ИМ ОШ = 1,78 (95 % ДИ 1,07–2,97 р = 0,03 GG vs СС+CG) и СС ОШ = 1,78–1,78 (95 % ДИ 1,07–3,02, р = 0,03 СС vs GС+GG) соответственно. Для rs1376251 (TAS2R50) показана протективная роль в отношении ИМ, генотип ТТ ОШ = 0,22 (95 % ДИ 0,05–0,91, р = 0,02 TT vs CC+CT), для остальных ОНП статистически достоверных данных получено не было.

   Выводы

   Выводы: подтверждены ассоциации rs1333049 (хр. 9), rs10757278 (хр. 9) с инфарктом миокарда и показана новая для России ассоциация с риском развития инфаркта миокарда rs1376251 (TAS2R50).

   Aim

   Aim: replication of association the SNPs with myocardial infarction (identified in recent GWAS) as markers of risk for myocardial infarction (MI) in a Siberian population.

   Methods

   Methods: Group of MI patients and control group (ratio 1:2) were formed on the sample of population 45–69 years old resident of Novosibirsk (9400 people), which was collected in international project HAPIEE (Health, Alcohol and Psychosocial factors In Eastern Europe). A total of 94 patients (60 men and 34 women with myocardial infarction after study HAPIEE). Control group: individuals without MI (420), matched for age and sex. Genomic DNA was extracted from venous blood by phenol-chloroform extraction. Polymorphism of genes tested by real-time PCR according to the protocol producer firms (probes TaqMan, Applied Biosystems, USA) on the instrument ABI 7900HT. The study was taken following SNPs: rs499818, rs619203, rs10757278 and rs1333049 (hr. 9), rs1376251, rs2549513, rs4804611, rs17465637. Results: Rs10757278 and rs1333049 for the show were the association with MI OR = 1.78 (95 % CI 1.07–2.97 p = 0.03 GGvsSS + CG), and SS OR = 1.78 (95 % CI 1.07–3.02 p = 0.03 SSvsGS + GG ), respectively. Just for rs1376251 (TAS2R50) shows protective role in relation to them TT OR = 0.22 (95 % CI 0.05–0.91 p = 0.02 TTvsCC + CT), for the remaining SNPs statistically valid data has been received.

      Conclusion

      Conclusion: Thus in this study were confirmed by the association rs1333049 (Mts. 9), rs10757278 (Mts. 9) with myocardial infarction and shows the new relationship with Russia for myocardial infarction for rs1376251 (TAS2R50).

rs499818rs619203rs10757278rs1333049rs1376251rs2549513rs4804611rs17465637rs499818rs619203rs10757278rs1333049rs1376251rs2549513rs4804611rs17465637ReferencesHorne B. D., Carlquist J. F., Muhlestein J. B. et al. Associations with myocardial infarction of six polymorphisms selected from a three-stage genome-wide association study // Am. Heart J. 2007. Nov; Vol. 154, N 5. P. 969–975.Horne B. D., Carlquist J. F., Muhlestein J. B. et al. Associations with myocardial infarction of six polymorphisms selected from a three-stage genome-wide association study // Am. Heart J. 2007. Nov; Vol. 154, N 5. P. 969–975.Larson M. G., Atwood L. D., Benjamin E. J. et al. Framingham Heart Study 100K project: genome-wide associations for cardiovascular disease outcomes // BMC Med. Genet. 2007. Vol. 19, N 8. Suppl 1. P. S5.Larson M. G., Atwood L. D., Benjamin E. J. et al. Framingham Heart Study 100K project: genome-wide associations for cardiovascular disease outcomes // BMC Med. Genet. 2007. Vol. 19, N 8. Suppl 1. P. S5.Ozaki K., Tanaka T. Genome-wide association study to identify single-nucleotide polymorphisms conferring risk of myocardial infarction // Methods Mol. Med. 2006. Vol. 128. P. 173–180.Ozaki K., Tanaka T. Genome-wide association study to identify single-nucleotide polymorphisms conferring risk of myocardial infarction // Methods Mol. Med. 2006. Vol. 128. P. 173–180.Samani N. J., Erdmann J., Hall A. S. et al. Genomewide association analysis of coronary artery disease // N. Engl. J. Med. 2007. Vol. 2357. P. 443–453.Samani N. J., Erdmann J., Hall A. S. et al. Genomewide association analysis of coronary artery disease // N. Engl. J. Med. 2007. Vol. 2357. P. 443–453.Hiura Y., Fukushima Y., Yuno M. et al. Validation of the association of genetic variants on chromosome 9p21 and 1q41 with myocardial infarction in a Japanese population // Circ. J. 2008. Vol. 72, N 8. P. 1213–1217.Hiura Y., Fukushima Y., Yuno M. et al. Validation of the association of genetic variants on chromosome 9p21 and 1q41 with myocardial infarction in a Japanese population // Circ. J. 2008. Vol. 72, N 8. P. 1213–1217.Schunkert H., Götz A., Braund P. et al. Repeated replication and a prospective meta-analysis of the association between chromosome 9p21.3 and coronary artery disease // Circulation. 2008. Vol. 117, N 13. P. 1675–1684.Schunkert H., Götz A., Braund P. et al. Repeated replication and a prospective meta-analysis of the association between chromosome 9p21.3 and coronary artery disease // Circulation. 2008. Vol. 117, N 13. P. 1675–1684.Shen G. Q., Li L., Rao S. et al. Four SNPs on chromosome 9p21 in a South Korean population implicate a genetic locus that confers high cross-race risk for development of coronary artery disease // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2008. Vol. 28, N 2. P. 360–365.Shen G. Q., Li L., Rao S. et al. Four SNPs on chromosome 9p21 in a South Korean population implicate a genetic locus that confers high cross-race risk for development of coronary artery disease // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2008. Vol. 28, N 2. P. 360–365.Van der Net J. B., Oosterveer D. M., Versmissen J. et al. Replication study of 10 genetic polymorphisms associated with coronary heart disease in a specific high-risk population with familial hypercholesterolemia // Eur. Heart J. 2008. Vol. 29, N 18. P. 2195–2201.Van der Net J. B., Oosterveer D. M., Versmissen J. et al. Replication study of 10 genetic polymorphisms associated with coronary heart disease in a specific high-risk population with familial hypercholesterolemia // Eur. Heart J. 2008. Vol. 29, N 18. P. 2195–2201.MONICA Monograph and Multimedia Sourcebook. World,s largest study of heart disease, stroke, risk factors, and population trends 1979–2002. Edited by Hugh Tunstall-Pedoe (with 64 other contributors for the WHO MONICA Project). WHO, Geneva, 2003. 237 р.MONICA Monograph and Multimedia Sourcebook. World,s largest study of heart disease, stroke, risk factors, and population trends 1979–2002. Edited by Hugh Tunstall-Pedoe (with 64 other contributors for the WHO MONICA Project). WHO, Geneva, 2003. 237 р.Смит К. Пульс-электрофорез и методы работы с большими молекулами ДНК / К. Смит, С. Калко, Ч. Кантор; под ред. К. Дейвиса // Анализ генома: пер. с англ. – М.: Мир, 1990. – С. 58–94.Смит К. Пульс-электрофорез и методы работы с большими молекулами ДНК / К. Смит, С. Калко, Ч. Кантор; под ред. К. Дейвиса // Анализ генома: пер. с англ. – М.: Мир, 1990. – С. 58–94.Максимов В. Н. Проверка взаимосвязи между девятью однонуклеотидными полиморфизмами и инфарктом миокарда на сибирской популяции / В. Н. Максимов [и др.] // Вестн. РАМН. – 2012. – № 5. – С. 24–29.Максимов В. Н. Проверка взаимосвязи между девятью однонуклеотидными полиморфизмами и инфарктом миокарда на сибирской популяции / В. Н. Максимов [и др.] // Вестн. РАМН. – 2012. – № 5. – С. 24–29.Helgadottir A., Thorleifsson G., Magnusson K. P. et al. The same sequence variant on 9p21 associates with myocardial infarction, abdominal aortic aneurysm and intracranial aneurysm // Nat. Genet. 2008. Vol. 40 (2). P. 217–224.Helgadottir A., Thorleifsson G., Magnusson K. P. et al. The same sequence variant on 9p21 associates with myocardial infarction, abdominal aortic aneurysm and intracranial aneurysm // Nat. Genet. 2008. Vol. 40 (2). P. 217–224.Anderson C. D., Biffi A., Rost N. S. et al. Chromosome 9p21 in Ischemic Stroke. Population Structure and Meta-Analysis // Stroke. 2010. Vol. 41, N 6. P. 1123–1131.Anderson C. D., Biffi A., Rost N. S. et al. Chromosome 9p21 in Ischemic Stroke. Population Structure and Meta-Analysis // Stroke. 2010. Vol. 41, N 6. P. 1123–1131.Шестерня П. А. Генетические предикторы инфаркта миокарда у лиц молодого возраста / П. А. Шестерня [и др.] // Кардиология. – 2013. – № 7. – С. 4–8.Шестерня П. А. Генетические предикторы инфаркта миокарда у лиц молодого возраста / П. А. Шестерня [и др.] // Кардиология. – 2013. – № 7. – С. 4–8.Куликов И. В. Генетические маркеры тяжести поражения коронарных сосудов у больных с острым коронарным синдромом / И. В. Куликов [и др.] // Бюл. СО РАМН. – 2013. – № 4. – С. 65–70.Куликов И. В. Генетические маркеры тяжести поражения коронарных сосудов у больных с острым коронарным синдромом / И. В. Куликов [и др.] // Бюл. СО РАМН. – 2013. – № 4. – С. 65–70.Ellis K. L., Pilbrow A. P., Frampton C. M. et al. A Common Variant at Chromosome 9P21.3 Is Associated with Age of Onset of Coronary Disease but Not Subsequent Mortality // Circ. Cardiovasc. Genet. 2010. Vol. 3, N 3. P. 286–293.Ellis K. L., Pilbrow A. P., Frampton C. M. et al. A Common Variant at Chromosome 9P21.3 Is Associated with Age of Onset of Coronary Disease but Not Subsequent Mortality // Circ. Cardiovasc. Genet. 2010. Vol. 3, N 3. P. 286–293.Buysschaert I., Carruthers K. F., Dunbar D. R. et al. A variant at chromosome 9p21 is associated with recurrent myocardial infarction and cardiac death after acute coronary syndrome: The GRACE Genetics Study // Eur. Heart J. 2010. Vol. 31, N 9. P. 1132–1141.Buysschaert I., Carruthers K. F., Dunbar D. R. et al. A variant at chromosome 9p21 is associated with recurrent myocardial infarction and cardiac death after acute coronary syndrome: The GRACE Genetics Study // Eur. Heart J. 2010. Vol. 31, N 9. P. 1132–1141.Theodoraki E. V., Nikopensius T., Suhorutsenko J. et al. ROS1 Asp2213Asn polymorphism is not associated with coronary artery disease in a Greek case-control study // Clin. Chem. Lab. Med. 2009. Vol. 47, N 12. P. 1471–1473.Theodoraki E. V., Nikopensius T., Suhorutsenko J. et al. ROS1 Asp2213Asn polymorphism is not associated with coronary artery disease in a Greek case-control study // Clin. Chem. Lab. Med. 2009. Vol. 47, N 12. P. 1471–1473.Shiffman D., Ellis S. G., Rowland C. M. et al. Identification of four gene variants associated with myocardial infarction // Am. J. Hum. Genet. 2005. Vol. 77. P. 596–605.Shiffman D., Ellis S. G., Rowland C. M. et al. Identification of four gene variants associated with myocardial infarction // Am. J. Hum. Genet. 2005. Vol. 77. P. 596–605.Yamada Y., Kato K., Oguri M. et al. Genetic risk for myocardial infarction determined by polymorphisms of candidate genes in a Japanese population // J. Med. Genet. 2008. Vol. 45, N 4. P. 216–221.Yamada Y., Kato K., Oguri M. et al. Genetic risk for myocardial infarction determined by polymorphisms of candidate genes in a Japanese population // J. Med. Genet. 2008. Vol. 45, N 4. P. 216–221.Myocardial Infarction Genetics Consortium Genomewide association of early-onset myocardial infarction with single nucleotide polymorphisms and copy number variants // Nat. Genet. 2009. Vol. 41, N 3. P. 334–341.Myocardial Infarction Genetics Consortium Genomewide association of early-onset myocardial infarction with single nucleotide polymorphisms and copy number variants // Nat. Genet. 2009. Vol. 41, N 3. P. 334–341.Bressler J., Folsom A. R., Couper D. J. et al. Genetic variants identified in a European genomewide association study that were found to predict incident coronary heart disease in the atherosclerosis risk in communities study // Am. J. Epidemiol. 2010. Vol. 171, N 1. P. 14–23.Bressler J., Folsom A. R., Couper D. J. et al. Genetic variants identified in a European genomewide association study that were found to predict incident coronary heart disease in the atherosclerosis risk in communities study // Am. J. Epidemiol. 2010. Vol. 171, N 1. P. 14–23.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.