Светлана Владимировна Михайлова, канд. биол. наук, научный сотрудник, и.о. зав. лабораторией молекулярной генетики человека,
630090, г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 10.
Svetlana V. Mikhailova, candidate of biological sciences, head of the laboratory of human molecular genetics,
10, Academician Lavrentiev ave., Novosibirsk, 630090.
Павел Сергеевич Орлов, младший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики человека,
630090, г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 10.
Pavel S. Orlov, junior researcher at the laboratory of human molecular genetics,
10, Academician Lavrentiev ave., Novosibirsk, 630090.
Динара Евгеньевна Иванощук, младший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики человека,
630090, г. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 10.
Dinara E. Ivanoshchuk, junior researcher at the laboratory of human molecular genetics,
10, Academician Lavrentiev ave., Novosibirsk, 630090.
Елена Владимировна Шахтшнейдер, канд. мед. наук, ведущий научный сотрудник, зав. сектором изучения моногенных форм распространенных заболеваний человека,
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1.
Elena V. Shakhtshneider, candidate of medical sciences, leader researcher in the laboratory of the molecular genetic investigations of therapeutic disease, head of the laboratory of the study of monogenic forms of human common disease,
175/1, Boris Bogatkov st., Novosibirsk, 630089.
Диана Вахтанговна Денисова, д-р мед. наук, главный научный сотрудник лаборатории профилактической медицины,
630089, г. Новосибирск, ул. Бориса Богаткова, 175/1.
Diana V. Denisova, doctor of medical sciences, chief researcher, laboratory of preventive medicine,
175/1, Boris Bogatkov st., Novosibirsk, 630089.
Многие аллели генов человека, ассоциированных с нарушениями метаболизма, имеют неполную пенетрантность. Их фенотипическое проявление зависит от условий жизни и, в частности, от пищевых привычек индивидуума. Мы проанализировали ассоциации 11 полиморфных сайтов девяти генов с индексом массы тела (ИМТ) и показателями липидного обмена (уровнем общего холестерина (ОХС), триглицеридов, холестерина липопротеинов высокой и низкой плотности (ХС ЛПВП и ХС ЛПНП)) в трех группах подростков г. Новосибирска, обследованных в 1999, 2009 и 2019 гг. В каждой из групп генотипировано от 187 до 665 человек по каждому из исследуемых сайтов. Для оценки связи полиморфных сайтов с фенотипом использовали однофакторный дисперсионный анализ (независимые ковариаты – пол и возраст). Для rs1800497 гена ANKK1, rs53576 гена OXTR, rs1360780 гена FKBP5 и rs4680 гена COMT, а также для тандемных повторов в промоторе гена MAOA, промоторе и интроне 2 гена SLC6A4 (как по отдельности, так и в составе гаплотипа) и в 3’-нетранслируемом регионе гена SLC6A3 ни в одной из групп не было найдено ассоциаций генотипов с ИМТ и показателями липидного обмена. Для аллельных вариантов гена APOE была получена ассоциация с уровнями ОХС: p = 0,042 и 0,034 соответственно в группах 1999 и 2009 гг. сбора, а также с ХС ЛПНП: p = 0,001 и 0,002 соответственно в группах 2009 и 2019 гг. При этом максимальные показатели для исследованных фенотипических параметров в группе 1999 г. приходились на носителей наиболее распространенного генотипа ε3ε3, а в группах 2009 и 2019 гг. были найдены у носителей наиболее атерогенного аллеля ε4. Таким образом, показано, что у подростков наблюдалась противоположная корреляция носительства генотипа ε4ε4 по гену APOE с уровнями ОХС и ХС ЛПНП в случае нормального (2009 и 2019 гг.) и сниженного (1999 г.) потребления калорий. Для rs6265 в гене BDNF уровень статистической значимости ассоциации распространенного аллеля C с уровнями ОХС и ХС ЛПНП прямо коррелировал с калорийностью рациона питания (p = 0,617 и 0,573; p = 0,049 и 0,090; p = 0,010 и 0,024 соответственно в группах 1999, 2009 и 2019 гг.).
Many genetic variants associated with metabolic disorders have incomplete penetrance in human. Their phenotypic manifestation depends on the life style factors. In this work, we compared the associations of genotypes at 11 polymorphic sites with body mass index (BMI) and lipid metabolism parameters (levels of total cholesterol (TC), triglycerides, high- and low-density lipoprotein cholesterol (HDL-C and LDL-C)) in three groups of adolescents from Novosibirsk, examined in 1999, 2009 and 2019. In each group, from 187 to 665 persons were genotyped at each site. One-way analysis of variance (independent covariates: gender and age) was used for evaluation. For rs1800497 in the ANKK1 gene, rs53576 in the OXTR gene, rs1360780 in the FKBP5 gene, and rs4680 in the COMT gene, as well as for tandem repeats in the promoter of the MAOA gene, promoter and intron 2 of the SLC6A4 gene (separately and as part of a haplotype), and 3′-untranslated region of the SLC6A3 no associations of genotypes with BMI and lipid metabolism parameters were found in any of the groups. For APOE genotype, an association was obtained with TC levels: p = 0.042 and 0.034, respectively, in the 1999 and 2009 collection groups, as well as with LDL-C: p = 0.001 and 0.002, respectively, in the 2009 and 2019 groups. Moreover, the maximum levels of TC and LDL-C were found among carriers of most common genotype ε3ε3 in 1999 group, and among carriers of atherogenic allele ε4 in other two groups. Thus, it was shown that in adolescents there was an opposite correlation of carriage of the ε4ε4 genotype for the APOE gene with the levels of total cholesterol and LDL cholesterol in the case of normal and reduced calorie intake. For rs6265 in the BDNF gene, the level of statistical significance of the association of the common C allele with TC and LDL-C levels was directly correlated with dietary caloric intake (p = 0.617 and 0.573; p = 0.049 and 0.090; p = 0.010 and 0.024, respectively, in the groups of 1999, 2009 and 2019).
The authors declare that there are no conflicts of interest present.